《学校风云》讲述了中五学生朱婉芳（袁洁莹饰）和好友郭小珍（李丽蕊饰）原本过着平凡的校园生活，却因帮派分子刀疤试图接近婉芳而卷入危险。刀疤曾在校门口殴打一名不良学生，导致对方意外死亡。警官海哥（林正英饰）要求婉芳出面作证，尽管刀疤的大哥潇洒（张耀扬饰）不断出言恐吓，婉芳还是受到温老师（刘松仁饰）和海哥正义感的感染，最终勇敢指认嫌疑人。
恼羞成怒的潇洒绑架婉芳并借机勒索，而温老师却在众目睽睽之下无力保护自己的学生。为了偿还欠款，婉芳和小珍只能靠打工维持生活。期间，刀疤暗中出手相助，让婉芳逐渐发现他冷酷外表下温柔的一面。没过多久，小珍得知男友佐治背叛了自己，在悲痛之中遭遇车祸身亡。好友的离世令婉芳原本就动荡的生活彻底崩塌。
本片是林岭东“风云三部曲”的最后一部，剧本依旧由其兄林岭南（南燕）执笔。
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