《暗杀坂本龙马》将故事聚焦于坂本龙马遇刺前的最后两日。幕府末期，日本局势风云激荡，群雄竞起，凭借非凡胆识与超前思想，坂本龙马在历史上留下了浓重一笔。庆应三年十一月十三日，京都落着冰雹，坂本龙马（原田芳雄 饰）暂居海援队常住的近江屋。“大政奉还”之后，政局更加动荡，佐幕派与勤王派都将他视作危险人物。百无聊赖之际，坂本与妓女厮混，又因手枪意外走火而招来刺客。昔日好友中冈慎太郎（石桥莲司 饰）以及偶然相识的右太（松田优作 饰）先后放下屠刀，与坂本建立起深厚情谊。慎太郎因此入狱，坂本和右太设法将他救出。然而右太随后遭人杀害，坂本与慎太郎在深夜密谋逃亡时，一张死亡之网也已悄然收紧。
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