《狄仁杰之夺命妖僧》讲述了垂拱四年，任江南巡抚使的狄仁杰在前往下辖临安县视察时，卷入了一桩扑朔迷离的失踪案。
老汉孟云德状告女婿李大有，指认他杀害了自己的女儿孟香莲和儿子孟杨；李大有则反过来指控岳父，认为孟云德将孟香莲藏了起来，意图把她改嫁他人。原来，孟香莲与李大有曾因争吵赌气回到娘家。孟香莲离开后，李大有的母亲因思念儿媳一病不起，无奈之下，李大有只得亲自前往孟家，苦苦劝说孟香莲回去照料婆婆。
孟香莲最终答应返回，但因天色已晚，决定第二天由弟弟孟杨陪同回家。李大有担心母亲的病情，当晚便独自赶了回去。可几天过去，孟香莲始终没有出现。李大有再次前往孟家索要妻子，却得知孟香莲和孟杨早已出发。两个大活人就此凭空消失，李大有怀疑岳父将妻子藏匿，想要另嫁他人；孟云德则认定女婿杀害了自己的女儿和儿子。面对这桩毫无头绪的案件，临安县令周从善束手无策，只能向狄仁杰求助。
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