《传国密诏》讲述明朝末年，崇祯帝下诏命太监王承恩的侄子王之明（寻峰 饰）护送太子（何威 饰）前往南京，希望旧臣遗老能够拥立太子继承皇位。途中两人遭遇前后夹击，王之明不得不假扮太子并故意被擒，以掩护真正的太子脱身。清皇太后（王惠 饰）将假太子放出，试图引出隐藏的真太子，最终真假太子一同落入清兵之手。
眼见大明气数将尽，清皇太后暗中挑动宫廷群臣内斗，企图令其从内部瓦解。王之明在疤面人（孙根发 饰）的协助下冒险救出太子。然而此时崇祯已经自缢身亡，马士英（顾也鲁 饰）等官宦趁机拥立新帝，建立南明朝，并派人前来接驾，实际上却是要暗杀太子。随后，马士英施展嫁祸之计，诬陷太子谋反，将其关入狱中。疤面人找到已经北返的王之明，劝他带兵东征……
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