《时间都去哪了》讲述了姚远（郭品超 饰）与林雨桐（杨紫 饰）的爱情故事。非典疫情肆虐期间，两人因缘相识，并在相处中逐渐产生了深厚感情。多年后，他们一同进入大学深造，意外在校园重逢，随后顺理成章地走到了一起，开始了漫长而甜蜜的恋爱。然而，原以为能够携手走进婚姻的两人，却因一场阴差阳错最终分道扬镳，从此失去联系。
后来，姚远成为一名工程师，并遇见了温柔的沈馨（高雅轩 饰）。由于父亲姚文成（焦恩俊 饰）身体状况一直欠佳，姚远决定与沈馨结婚，以完成父亲的心愿。没想到，在婚礼当天，大学室友乔治突然出现，带来了林雨桐当年隐瞒、且与她下落不明有关的秘密。面对这突如其来的真相，姚远百感交集，也陷入了对未来选择的挣扎之中。
