《武神苏乞儿之红莲虫蛊》将故事置于清末鸦片战争前夕。彼时清廷国力衰弱，鸦片泛滥，百姓深受其害。民团教头黄飞鸿遭神秘组织火莲教暗算，生死不明，原本推进中的禁烟行动也被迫陷入停滞。危急关头，苏灿受命与江湖丐帮女子明心携手，追查火莲教贩卖鸦片的证据，并冒险潜入敌营营救黄飞鸿。
火莲教以“仙草”为名包装鸦片，借助奇门异术蛊惑民众。调查过程中，能够操纵傀儡药人的绝偃道长、阴险神秘的邪皇，以及立场难辨、亦敌亦友的女杀手明灵相继现身。邪皇设下圈套，陷害苏灿，使他家产被抄、身份尽失，沦为乞丐。这个一向桀骜不驯的年轻人跌入人生低谷，几乎陷入绝境。幸得倾心于他的明心相助，丐帮长老将禁地绝学传授给苏灿。重新振作后的苏灿联合禁烟大臣李大人，与火莲教展开最终决战，而苏乞儿也由此踏上了救国之路。
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