《深海危机》讲述了核武专家斯蒂尔准备向世人揭开埋藏心底多年的秘密，却在关键时刻遭到劫持并被杀害，随身装有绝密资料的手提箱也不知所踪，事件因此震动全球。
不久后，中国领海外出现一艘神秘舰船。一群身份不明的外籍人士企图打捞冷战时期某大国遗留在深海海底的核弹，并以此发动恐怖袭击。他们的目标并非某座大都市，而是计划在活跃的环太平洋地震带引爆核弹，诱发超级地震和巨大海啸，使沿海数十个国家面临灭顶之灾。
危急关头，在中国国家反恐中心与军方的全力配合下，一对欢喜冤家并肩作战，最终成功挫败恐怖分子的阴谋，挽救了上千万人的生命，两人的夫妻感情也在共同经历生死考验后得到升华。
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