热血高校2的故事发生在GPS与芹泽军团激战后的短暂和平期。芹泽多摩雄（山田孝之 饰）让出了铃兰高中的老大位置，泷谷源治（小栗旬 饰）则仍在不断挑战令人畏惧的林田惠（深水元基 饰）。八个月后，铃兰高中与宿敌凤仙学院之间的旧日恩怨再度被掀起。
两年前，川西仁（阿部進之介 饰）率领铃兰军团与美藤真喜雄带领的凤仙学院爆发大战。混战中，川西刺死了真喜雄，随后被送进少管所。为了避免更多伤亡，铃兰与凤仙双方签订了停战协议。两年后，川西出狱，却遭到凤仙学院成员追杀。芹泽出面阻拦，泷谷的介入则彻底破坏了两校之间的停战关系。继承美藤真喜雄遗志的鸣海大我（金子ノブアキ 饰）与美藤龙也（三浦春馬 饰），决定借此机会彻底摧毁宿敌铃兰高中。
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