《鸡皮疙瘩NO.3》由序章及四个故事组成。
序章中，主人公下班回到家，意外发现邻近公寓的窗帘后有一个男人正窥视着自己。惊恐之下，主人公拨打了报警电话，然而……
第一话《甜蜜诱惑是死亡的引路人》中，刚搬进公寓的主人公被隔壁情侣制造的噪音惹恼，抗议时还狠狠敲打了墙壁。第二天晚上，主人公听见隔壁房间传来喘息声，便把耳朵贴在墙上偷听，没想到……
第二话《杂音与无音的因果律》中，主人公坐在车站月台的椅子上，一边用大音量听音乐，一边等待列车。此时，身后正在候车的人们不知为何伴随着凄厉的惨叫声接连逃离，而主人公对此却浑然不觉……
第三话《伪装杀意的去向》中，主人公听到连环杀人案的新闻。就在这时，一个外貌特征与连环杀人犯十分相似的男人前来检查火灾报警器。主人公将他请进了房间，然而……
第四话《关于概念的误解与真相》中，最近……
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