《青之箱第二季》讲述了荣明高中男子羽毛球部的猪股大喜。作为一所初高中一贯制的体育强校，荣明高中每天清晨都充满了训练的身影，而大喜最期待的，便是见到比自己高一年级的女子篮球部王牌鹿野千夏。两人在晨练中日复一日地相遇，大喜也在不知不觉间喜欢上了这位学姐。
某天，千夏因为父母被调往海外工作，开始寄住在猪股家。原本只是晨练时相遇的普通前后辈，两人的关系也因此发生了彻底的变化。伴随着社团活动、学业生活与青涩的恋情，大喜迎来了人生中一段难以忘怀的青春时光。
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