《杀即生》的故事发生在关原之战结束35年后。随着时代变迁，日本逐步迎来和平。然而，一群名为“群凶”的可怕怪物突然出现，它们以人类血肉为食，四处袭击百姓。幕府为消灭群凶，暗中组织讨伐队，并将事发地区彻底焚毁，试图掩盖这一切。
远离动荡的多胡宿，前忍者凛（木村文乃 饰）隐瞒身份，跟随医生源三郎（高桥克实 饰）生活，并照料与自己没有血缘关系的养女时（田牧空 饰）。为了寻找能够治愈时病症的药物，凛前往一座村庄，却在那里目睹满地血迹与尸骨，随即遭到恐怖异形“群凶”的袭击。尘封已久的悲惨往事，也在这一刻重新涌上心头。为了守护如亲生女儿般重要的时，凛毅然踏上充满生死危机的旅途。
另一边，男子士郎（田中树 饰）虽然变成了“半群凶”，却依旧保有人类意识，因此被世人憎恨并囚禁起来。他始终无法得知自己的身世，为解开关于自身来历的谜团，开始踏上寻找某人的旅程。
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