《7号差馆粤语》讲述重案组高级督察方正（许志安）的故事。方正屡破奇案，在他看来，庆功会上争相邀功的其他部门同事大多能力平庸，许多案件之所以能够侦破，全靠自己和阿泽（雷宇扬）等手下出生入死。因此，他的处事方式难免显得独断而高傲。
一次缉匪行动中，方正因等不及飞虎队赶到，擅自下达行动命令，结果导致两名同事当场殉职，他本人也身中枪伤并陷入昏迷，在医院一躺就是两年。醒来后，他发现母亲已经去世，昔日女友也嫁作他人，身边的一切早已物是人非。唯一让他感到意外的是，昏迷期间一直悉心照料他的护士Oscar（李丽珍）对他产生了感情。
经过一段时间的恢复训练，方正的身体和能力逐渐恢复到昏迷前的状态，却意外获得了看见鬼魂的本领。起初他对此十分恐慌，后来在已故心理医生阿杰（张达明）的一番开解下，才慢慢放下心结。
重返警队后，方正主动请缨，接手一宗困扰警方两年的连环女护士奸杀案。两年间，已有六名女护士遇害，其中大多数尸体下落不明。案件之所以重新受到关注，是因为其中一名受害者竟自行来到警察局，向阿泽报案。凭借冷静缜密的头脑，方正认定凶手是一名智商极高的男性。
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