自1982年电视动画超时空要塞Macross开播以来，Macross系列陆续推出了剧场版、OVA以及新的电视动画，始终是备受欢迎的机器人动画名作。作为系列最新作，MacrossF（Frontier）于2008年春季作为电视新番播出，距离1995年完结的Macross7已有13年之久。
故事发生在西历2059年，也就是Macross7之后14年、超时空要塞Macross之后50年的世界。以银河中心为目标、搭载着约1000万居民的移民船团Macross·Frontier成为故事的舞台。作品延续了Macross系列一贯的核心元素，包括贯穿故事的歌姬、能够变形的战斗机，以及飞行员与女主角之间的三角关系，同时围绕两位性格鲜明的女主角展开，融入了偶像与校园等全新的故事尝试。
来自邻近船团Macross·Galaxy的当红偶像歌手シェリル･ノーム，为举办演唱会来到Macross·Frontier。她在银河流行歌曲排行榜上长期名列前茅，是备受瞩目的高傲偶像。憧憬着她的少女ランカ･リー，则是一名在中华餐馆打工的普通女高中生。兰花唯一的亲人，是与她年龄相差悬殊的哥哥オズマ。オズマ隶属于特殊军事部队SMS，是可变战机部队中的精锐飞行员，但为了保护妹妹，他一直隐瞒着自己驾驶危险战斗机的事实。
就在兰卡期待已久的雪莉露演唱会即将举行之际，她在前往会场的途中遇见了身为受训飞行员候补的高中生早乙女アルト。与此同时，Macross·Frontier突然遭到未知敌人的袭击。来袭者既不是地球人，也不是异星人，而是身份不明的宇宙生物。新统合军的部队接连被击溃，面对能够压制VF部队的强大攻击，宇宙生物甚至侵入了市民居住区。为应对不断恶化的局势，オズマ率领SMS的VF-25部队出击。神秘宇宙生物的目的究竟是什么，人类又能否平安度过这场危机？
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