清朝末年，官场腐败、百姓困苦。浙江一带有一名蒙面侠士“铁猴子”，连续两年劫富济贫，让那些靠卖官鬻爵牟利的知府们寝食难安。白天，他则以大夫杨天淳（于荣光饰）的身份行医济世，凭借高超医术和仁厚为人深受乡邻敬爱。
为了抓住铁猴子，知府不惜严刑拷打无辜百姓。恰好路过此地的黄麒英（甄子丹饰）与儿子黄飞鸿也被卷入这场风波。知府见黄麒英武艺高强，便扣押黄飞鸿，以此逼迫他捉拿铁猴子。黄麒英与铁猴子交手之后，因彼此志向相投而惺惺相惜。
不久，朝廷钦差来到浙江，听闻铁猴子“作乱”，便出手将其击伤。众人这才发现，钦差的真实身份竟是少林叛徒衍空（任世官饰）。身为少林弟子的黄麒英随即与铁猴子联手，决心为少林清理门户。
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