《飘香剑雨》讲述了一个武林正道衰微、邪派横行的黑暗年代。李寻欢等大侠相继退隐后，正道人才凋零，江湖逐渐被五大邪派势力控制。吕南人为争夺绝艺“飘香一剑”遭同门出卖，险些丧命，幸得神秘高手老李及时相救，并将他带回正道藏身之地聚贤山庄。
老李看出吕南人本性未泯，便悉心栽培他，希望他成为新一代正派领袖钟静之的得力助手。然而，吕南人过去曾行恶多端，始终无法取得少庄主孙敏的信任。起初仍与邪道藕断丝连的他，在与孙敏等人长期相处后逐渐受到感化，行事作风也开始转向正道。
与此同时，天争教教主得知吕南人的下落后，处心积虑地诱使他成为手中的棋子，企图一举铲除聚贤山庄。吕南人原本打算置身事外，却始终割舍不下与孙敏、老李之间的情谊，最终毅然挺身而出。
