《迷失第四季》中，第三季后半段，掌握Ben生死大权的Jack似乎占据了主动。他要求释放Kate和Sawyer，让两人平安返回小岛，而自己则选择留下。然而，Jack真正的动机究竟是什么？Kate最终在Jack与Sawyer之间作出了选择，她的感情是否真挚，也成为新的疑问。
Juliet作出了一个危险的决定。Eko死后，Locke继续探寻小岛隐藏的秘密，这让Sayid开始怀疑，Locke或许另有目的，并不只是为了幸存者。Sun和Jin迎来了新生命，但孩子究竟是不是Jin的，仍然没有答案。Charlie重新与Claire以及她的孩子Aaron建立起友谊，可Desmond向他投出的炸弹，却将永远改变他的命运。
舱门破裂、电磁波泄露后，小岛和外面的世界将受到怎样的影响？Penny Widmore能否找到这座神秘的小岛，以及她深爱的Desmond？幸存者们又能否与外界取得联系？救援即将到来，但他们不知道是否应该相信Charlie临终前留下的警告，而救援船上的人……
