《法证先锋2国语》中，法政部高级化验师Tim Sir（欧阳震华 饰）博学多才，凭借精湛的物证检验技术屡次侦破奇案。他的下属兼好友阿Sam（林文龙 饰）是一名优秀法医，正准备与相恋多年的女友汀汀（钟嘉欣 饰）步入婚姻殿堂。阿Sam的好友Ivan（郑嘉颖 饰）从英国归来，并在一次炸弹危机中成功将炸弹安全引爆，因此得到Tim Sir的另眼相看。
与此同时，扫毒组高级督察马帼英（佘诗曼 饰）带领手下追查香港大毒枭戴贵。戴贵逼走另一名毒枭石头勇后，独占香港的毒品市场。扫毒组与法证组联手追查戴贵手下与境外毒贩的交易，并准备将得意忘形的戴贵一举擒获，没想到戴贵乘坐的汽车突然发生爆炸。事发时，汀汀和Tim Sir的女友、重案组高级督察小柔（蒙嘉慧 饰）恰好经过，汀汀当场身亡，小柔则身受重伤。即将结婚的阿Sam得知噩耗后悲痛万分。
之后，帼英调往重案组任职，并怀疑戴贵的爆炸案是石头勇归来复仇所为，于是着手展开调查。就在案件陷入僵局之际，阿Sam仿佛在冥冥之中得到汀汀的提示，最终找到了石头勇犯罪的证据。
